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Live du jeudi 15 novembre de 18h à 19h / Live session on Thursday 15 November from 6pm to 7pm

Posez vos questions avant le live

Indiquez dans le fil de discussion dédié dans le forum les sujets que vous souhaitez aborder ou les questions que vous voulez poser aux auteurs.

Procédure pour participer à l'événement

Pour suivre en direct l'intervention il faudra juste cliquer sur le lien suivant à l'heure que nous avons convenue (18h00)

Pour participer et poser vos questions en direct :

  • Pour ceux qui ont un compte YouTube, un chat est mis à disposition dans un espace dédié à droite de la vidéo.
  • De plus, nous avons mis à votre disposition un pad où vous pouvez rédiger vos questions  (mot de passe : access).

Ask your questions before the live event

Indicate in the dedicated discussion thread in the forum the topics you want to address or the questions you want to ask the authors.

Procedure for participating in the event

To follow the intervention live, just click on the following link at the time we have agreed (6:00 pm)

To participate and ask your questions live:

  • For those who have a YouTube account, a chat is available in a dedicated area on the right of the video.

Echanges via le Chat de Youtube

Rémi Letot
ditaa aussi

Arnaud Legrand
xmind

Konrad Hinsen
Pour org-mode il y a l'extension org-brain

Rémi Letot
ah oui les mindmappers, freemind,... mais j'ai un peu de mal pour la prise de notes dans ces outils. Je trouve que ça devient très vite très confu

Konrad Hinsen
C'est mon expérience aussi, mais j'ai des collègues qui les aiment bien. À chacun ton outil !

josédu13 lolo
Y a t-il beaucoup de revues scientifiques qui publient des rapports dynamiques reproductibles (avec code intégré) ? Si oui dans quels domaines ?

Rémi Letot
oui c'est utile, pour dégrossir un sujet par exemple

christophe.pouzat
Biostatistics publie des articles avec codes, etc et signale les articles reproductibles avec une étiquette spécifique

Rémi Letot
il y a le problème de l'hébergement, mais plus fondamentalement, difficile de faire du reproductible si personne ne peut le lire...

Konrad Hinsen
ReScience ne fait que du reproductible.

christophe.pouzat
Mais pour soi même c'est déjà utile

Rémi Letot
org-crypt permet de crypter certaines parties d'un document sur base d'un tag

Rémi Letot
org-crypt permet de crypter certaines parties d'un document sur base d'un tag

Rémi Letot
je l'utilise extensivement pour stocker des mots de passe de systèmes et de clients dans mes documents org, dès qu'on sauve le document ça crypte la pratie taguée «crypt»

Konrad Hinsen
keybase.io


Rémi Letot
QUESTION: dans org-mode, est-il possible de réinitialiser un document pour supprimer tous les résultats ? J'ai trouvé pour recalculer toute une arborescence, mais pas pour la réinitialiser

Konrad Hinsen
org-babel-remove-result-one-or-many

Rémi Letot
diantre, MERCI

severine giordan
je n'ai pas bien entendu le nom du git qui facilite la collaboration ! merci !

Konrad Hinsen
Pour la collaboration, git tout seul est presque parfait.

Konrad Hinsen
Les extensions que j'ai mentionnées sont git-lfs et git-annex pour les grands fichiers de données.

Inria Learning Lab
#reproducibleresearch

Vincent SZYMANSKI
Est-il possible d'avoir une communauté avec Arnaud, Konrad et Christophe après ce MOOC sur irc ou autre ??

Vincent SZYMANSKI
Dernière question : Est-il possible d'avoir le MOOC en zip à l'issu de celui-ci cela éviterait d'utiliser un aspirateur web ?

Sebastien Guyader
Deuis peu il y a "Packrat" (RStudio), qui semble être le moyen de lier l'ensemble des librairies utilisées avec notre code pour que, je cite "notre code R soit mieux isolé, portable et reproductible"

Sebastien Guyader
Packrat est accessible via les options des projets RStudio

der
Pour l'INRA, dont je suis chercheur : on nous parle de l'Open Science depuis un certain temps, mais pour le moment on ne nous a pas donné d'outils pour le faire de manière ouverte et pérenne.

Stéphane leveau
@Vincent SZYMANSKI merci

Vincent SZYMANSKI
il faut utiliser les environnements "env" python pour gérer les problèmes de version. Comment utilise-t-on ceci ?


Vincent SZYMANSKI
Est-il possible d'avoir une communauté avec Arnaud, Konrad et Christophe après ce MOOC sur irc ou autre ??

Vincent SZYMANSKI
Dernière question : Est-il possible d'avoir le MOOC en zip à l'issu de celui-ci cela éviterait d'utiliser un aspirateur web ?


Sebastien Guyader
Depuis peu il y a "Packrat" (RStudio), qui semble être le moyen de lier l'ensemble des librairies utilisées avec notre code pour que, je cite "notre code R soit mieux isolé, portable et reproductible"

Sebastien Guyader
Packrat est accessible via les options des projets RStudio

Konrad Hinsen
(c'est ouvert à d'autres domaines)

Rémi Letot
pourquoi ne pas les modifier ??? CC c'est justement qu'on peut les modifier, non ?


Sebastien Guyader
Depuis peu il y a "Packrat" (RStudio), qui semble être le moyen de lier l'ensemble des librairies utilisées avec notre code pour que, je cite "notre code R soit mieux isolé, portable et reproductible"

Sebastien Guyader
Packrat est accessible via les options des projets RStudio

Konrad Hinsen
(c'est ouvert à d'autres domaines)

Rémi Letot
pourquoi ne pas les modifier ??? CC c'est justement qu'on peut les modifier, non ?

Vincent SZYMANSKI
à la place d'Excel il y a le tableur d'org-mode

Vincent SZYMANSKI
pardon le tableur d'emacs...

Sebastien Guyader
LibreOffice est de plus en plus compatible avec MS Office