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  • Début du Cours
  • 29 jan 2018
  • Fin du cours
  • 02 avr 2018
  • Effort estimé
  • 02:30 h/semaine
  • Langue
  • Anglais

About This Course /A propos du cours

Tuberculosis has been a scourge of humanity for hundreds of years. In the 18th and 19th centuries, tuberculosis was called the white plague and in some countries in Europe and the US was responsible for 20% or more of all deaths. Today, out of all infectious agents, tuberculosis remains the biggest killer, surpassing even HIV and malaria. In 2015, according to WHO, there were nearly 10.4 million new cases of tuberculosis and around 1.8 million people died from the disease, making it one of the top 10 causes of deaths worldwide. Although there are plans to eliminate it within the next couple of decades, the incidence is currently only falling by about 1.5% per year. Part of the problem is the nature of the disease, which takes months to develop and requires months of multi-drug chemotherapy to cure. It can also stay latent for decades and then emerge to cause serious illness. Another problem, this one man-made, is the drug resistance and multi-drug resistance that make TB much harder to cure.

To provide an up-to-date overview of the disease, the Institut Pasteur has created a MOOC dedicated to Tuberculosis. This course will provide a knowledge base that goes from the basics of TB to the current state of knowledge on various aspects of tuberculosis: the clinical picture, epidemiology, pediatric TB, factors affecting susceptibility to the disease, including HIV, diabetes and human genetics, immunology, vaccines, diagnosis, current and future ways to detect drug resistance, and how to treat drug sensitive and multi-drug resistant strains. It will also discuss clinically important non-tuberculous mycobacterial infections and how to diagnose and treat them. It will present recent advances in molecular techniques for diagnosis and drug sensitivity testing, including Whole Genome Sequencing, and the new, shorter and more effective treatment regimens to cure Multi-Drug Resistant TB.

The course aims at providing a broad overview of the current state of knowledge about tuberculosis for physicians, nurses and other health and public health workers, microbiologists, pharmacists, researchers and students. It will serve as a valuable update for people working with tuberculosis, a thorough introduction for those who are new to the field and a great opportunity for all those who want to broaden their understanding of the disease.

La tuberculose est un fléau de santé publique depuis des centaines d’année. Aux 18e et 19e siècles, on la qualifiait de peste blanche et dans certains pays en Europe et aux Etats-Unis, la tuberculose était responsable de 20% de tous les décès. Aujourd’hui, elle reste la maladie infectieuse la plus mortelle, devant le SIDA et le paludisme. En 2015, selon les chiffres de l’OMS, 10,4 millions de personnes ont contracté cette maladie et 1,8 million en sont mortes, faisant de la tuberculose l’une des dix premières causes de mortalité dans le monde. Malgré des plans d’élimination de la tuberculose dans les deux prochaines décennies, l’incidence annuelle ne diminue que de 1,5% par an. Le problème provient en partie de la nature même de la maladie, qui se développe lentement pendant des mois et dont le traitement nécessite plusieurs mois d’une association de plusieurs médicaments. La tuberculose peut aussi rester latente pendant des décennies puis émerger soudain et provoquer une maladie grave. Une autre difficulté, liée celle-ci à l’homme, provient de l’apparition de résistances au traitement, voire de multi-résistances, qui rendent la guérison beaucoup plus difficile.

L’Institut Pasteur a entrepris de réaliser ce MOOC pour faire le point sur la tuberculose et ses derniers développements. Ce MOOC couvrira pour les participants des sujets très variés, allant des connaissances de base jusqu’aux dernières découvertes sur les aspects cliniques, l’épidémiologie, la tuberculose infantile, les facteurs influant sur la susceptibilité à la maladie (infection par le VIH, diabète, facteurs génétiques), la réponse immune à l’infection, les vaccins, les méthodes de détection de la résistance et le développement de traitements efficaces contre la tuberculose (y compris multirésistante. Ce MOOC évoquera aussi les cas d’autres infections à mycobactéries (en dehors de la tuberculose), la manière de les détecter et de les traiter. Ce MOOC présentera également les avancées récentes des techniques moléculaires de diagnostic et de test de sensibilité aux médicaments, y compris le séquençage du génome complet et les nouveaux traitements contre la tuberculose multirésistante.

Ce MOOC vise à apporter un panorama large sur la tuberculose, s’appuyant sur les dernières découvertes des laboratoires, aux professionnels de santé et de santé publique, aux microbiologistes, aux pharmaciens, aux chercheurs et aux étudiants en sciences de la vie. Ce MOOC se propose également de servir de mise à jour pour les médecins, les infirmières et les travailleurs sociaux travaillant sur la tuberculose ou dans la prise en charge des malades, mais également d’introduction solide pour ceux qui ne sont pas familiarisés avec la maladie, souhaitent élargir leurs connaissances et améliorer leur compréhension.

Format/Format

This MOOC is organized in 6 weeks. Each week is composed of 4 to 6 sequences. In each sequence, you find a 10 minute video and two multiple choice questions (MCQ) to help students check their understanding. The videos are in English subtitled in French and in English. All the tests are in English. A weekly evaluation is performed using about 10 MCQs and, at the end of the course, a final evaluation is performed with 30 MCQs.

Ce MOOC est composé de 6 semaines d’enseignement. Chaque semaine comporte 3 à 6 séquences. Chaque séquence se compose d’une vidéo d’environ 10 minutes et de deux QCM afin que les étudiants testent leurs connaissances. Les vidéos sont en anglais sous-titrées en français et en anglais. Tous les tests sont en anglais. Une évaluation hebdomadaire est faite avec une dizaine de QCMs et un test final, à la fin du cours, avec une trentaine de QCMs.

Requirements /Prérequis

This MOOC is aimed at people interested in Tuberculosis: microbiologists, researchers in infectious diseases, biologists, physicians, epidemiologists, public health workers and patient education, as well as students in any of these areas.

A bachelor of science, a degree in a health related field or a good scientific background is recommended to be able to participate in this MOOC.

Ce MOOC s'adresse à tous ceux qui souhaitent mieux comprendre les données actuelles et les challenges futurs de la tuberculose : microbiologistes, chercheur en infectiologie, médecins internes et infectiologues, épidémiologistes, médecins de santé publique et responsables institutionnels.

Il est conseillé de disposer d’une licence de sciences, d’un diplôme dans le domaine de la sante ou plus généralement de connaissances en sciences pour suivre ce MOOC.

in collaboration with /en collaboration avec

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The MOOC Tuberculosis has been produced by the Institut Pasteur, in collaboration with Shenzen Nanshan Center for Chronic Disease Control (Nanshan CCDC).

Le MOOC Tuberculosis a été produit par l’Institut Pasteur, en collaboration avec Nanshan Center for Chronic Disease Control (Nanshan CCDC)

Course Staff

Course Staff Image #1

Howard Takiff

Howard Takiff was trained as a MD, specializing in infectious disease. After working on adenovirus and herpesvirus, he studied bacterial genetics in E. coli and then shifted to apply genetics to study tuberculosis. He set up his own lab in Caracas, Venezuela in 1991, focusing on TB resistance, virulence determinants and molecular epidemiology. He has worked as a tuberculosis clinician in Africa, New York City and Venezuela. He began working at the Institut Pasteur in 2015 and now works at the Shenzhen Nanshan Center for Chronic Disease Control on tuberculosis in Shenzhen, China.

Médecin de formation, formé en médecine interne et spécialiste des maladies infectieuses, Howard Takiff a d’abord travaillé sur les adénovirus, les herpèsvirus et la génétique bactérienne chez e. coli, avant d’appliquer la génétique à la tuberculose. En 1991, il crée son laboratoire à Caracas, au Venezuela, travaillant notamment sur la résistance à la tuberculose, les facteurs de virulence et l'épidémiologie moléculaire. Howard Takiff a également travaillé sur la tuberculose en Afrique, à New York et au Venezuela, en tant que clinicien. Il a commencé à travailler à l'Institut Pasteur en 2015, et travaille désormais sur la tuberculose au Shenzhen Nanshan Center for Chronic Disease Control

Course Staff Image #1

Brigitte GICQUEL

Brigitte Gicquel (BG) is a biologist. She first studied molecular interactions between MTB and host cells and was a pioneer in the identification of molecular diagnosis probes and genes involved in virulence of MTB, the basis of a vaccine candidate under clinical trials. BG coordinated the efforts of the European Commission to find new vaccines against TB and is now the coordinator on the European NAREB project on nanotechnology and Infectious Diseases. She heads the Mycobacterial Genetics Unit at Institut Pasteur in Paris, and the Emerging Bacterial Pathogens Unit at the Institut Pasteur of Shanghai Where she works in collaboration with the CCDC

Brigitte Gicquel (BG) est biologiste. Elle a d’abord étudié les interactions moléculaires entre MTB) et les cellules hôtes. Elle a été pionnière dans l'identification des sondes de diagnostic moléculaire et des gènes impliqués dans la virulence de MTB, des bacilles de la tuberculose qui sont à la base d'un vaccin candidat en essais cliniques. BG a coordonné les efforts de la Commission européenne pour trouver de nouveaux vaccins contre la tuberculose et coordonne désormais le projet européen NAREB sur les nanotechnologies et les maladies infectieuses. Elle dirige l'Unité de Génétique Mycobactérienne de l'Institut Pasteur de Paris ainsi que l'Unité des Pathogènes Bactériens Emergents de l'Institut Pasteur de Shanghai où elle travaille en collaboration avec le CCDC

Course Staff Image #1

Catherine Pierre-Audigier

Catherine Pierre-Audigier was trained as an emergency room physician before choosing to work on infectious diseases. She specialized in molecular biology applied to tuberculosis. As a MD-PhD, she works both in the hospital and in the Mycobacterial Genetics Unit, at the Institut Pasteur. Within the institute, she has participated in many collaborative projects on the implementation of new TB diagnosis tools and detection of resistant TB in various Asian and African counties.

Catherine Pierre-Audigier a débuté sa carrière en réanimation médicale à l'hôpital avant de choisir de travailler sur les maladies infectieuses. En tant que médecin et chercheuse, elle travaille à la fois à l’hôpital (en tant que praticienne attachée en Laboratoire de microbiologie) et au sein de l'Unité de génétique mycobactérienne de l'Institut Pasteur. Elle a participé au sein de l’Institut à de nombreux projets collaboratifs sur la mise en place de nouveaux outils de diagnostic de la tuberculose et sur la détection de la résistance aux antituberculeux dans plusieurs pays d’Afrique et d’Asie.

With the participation of/ Avec la participation de : Laurent Abel, Elisabeth Bouvet, Priscille Brodin, Roland Brosch, Philip Butcher, Susan Dorman, Christophe Delacourt, Darragh Duffy, Philippe Glaziou, Jean-Louis Herrmann, Véronique Joly, Giulia Manina, Laleh Majlessi, Olivier Neyrolles, Sophie Pease, Liu Shengyuan, Dick van Soolingen, Steffen Stenger, Ludovic Tailleux, Arnaud Trebucq, Nicolas Veziris, Adam Witney .

Course syllabus /plan du cours

Week 1: Introduction and TB EpidemiologyPremière semaine : Introduction et Epidémiologie de la tuberculose

  • Presentation of patients/Présentation des patients
  • History of TB/Histoire de la tuberculose
  • TB Epidemiology/Epidémiologie de la tuberculose
  • IGRA tests or modern tools to identify tuberculosis infection/Les tests IGRA ou des instruments modernes pour identifier une infection tuberculeuse
  • Pediatric tuberculosis/Tuberculose chez l’enfant
  • Tuberculosis, HIV, Diabetes/Tuberculose, VIH et Diabète

Week 2: TB ImmunologyDeuxième semaine : Immunologie de la tuberculose

  • Immunology of TB/Immunologie de la tuberculose
  • Mycobacterium tuberculosis interactions with host cells/Interactions entre Mycobacterium tuberculosis et les cellules de l’hôte
  • Interaction between Mycobacterium tuberculosis and the Host Immune System/Interactions entre Mycobacterium tuberculosis et le système immunitaire de l’hôte
  • BCG vaccination and other vaccines against tuberculosis/Vaccination par le BCG et autres vaccins contre la tuberculose
  • Human genetics of tuberculosis/Génétique humaine de la tuberculose
  • Milieu intérieur: standardized immune-monitoring to define boundaries of a healthy immune response/Milieu intérieur: Monitorage standardisé de la réponse immune normale

Week 3: TB genomes: evolution, molecular epidemiology, drug resistanceTroisième semaine: Génomique de la tuberculose: Evolution, épidémiologie moléculaire, résistance au traitement

  • The evolution of tuberculosis-causing mycobacteria/Evolution des mycobactéries entraînant la tuberculose
  • History of Drug resistance/Histoire de la résistance de la tuberculose aux traitements
  • Whole genome sequencing of MT as an epidemiological marker/Séquençage du génome de Mycobacterium tuberculosis
  • History of Drug resistance/Histoire de la résistance de la tuberculose aux traitements
  • The mutations that define XDR-TB/Les mutations qui définissent la résistance extensive aux traitements

Week 4: Drug ResistanceQuatrième semaine: Résistance au traitement

  • GeneXpert® and Xpert® MTB/RIF case studies/Etudes de cas résistants par le test MTB/RIF
  • Cultures, Hain, Isoniazid and Rifampicin resistance/Résistance à l’isoniazide et à la rifampicine
  • Clinical usefulness of while genome sequencing: potential for improved management of MDR and XDR TB/Utilité du séquençage total du génome: intérêt pour la prise en charge des cas de multirésistance et de résistance extensive
  • Drug resistance prediction by genome sequencing/Prédiction de la résistance au traitement par séquençage

Week 5: Treatment Cinquième semaine: Traitement

  • Treatment of tuberculosis including MDR and XDR cases Traitement de la tuberculose, incluant les cas de multirésistance et de résistance extensives
  • The short-course treatment for multidrug resistant tuberculosis/ les protocoles courts de traitement de la tuberculose multirésistante
  • New drugs, new regimens and clinical trials Part I: Principles of TB drug discovery, regimen-building, and clinical trials/ Nouveaux médicaments, nouveaux protocoles et essais cliniques. 1ère partie : Principes de la découverte de médicaments, de nouveaux protocoles thérapeutiques et des essais cliniques
  • New drugs, new regimens and clinical trials Part II: Contemporary examples in TB Drug Development and Clinical Trials/ Nouveaux médicaments, nouveaux protocoles et essais cliniques. 2ème partie : Exemples actuels du développement de nouveaux médicaments et d’essais cliniques.
  • NTM detection and speciation; when to treat?/Détection et spéciation des mycobactéries non tuberculeuses

Week 6: Future Approaches and ChallengesSixième semaine: Nouvelles approches, nouveaux challenges

  • Novel strategies for tuberculosis treatment/nouvelles strategies pour le traitement de la tuberculose
  • Tuberculosis Drug Discovery Recherche de nouveaux médicaments anti tuberculeux
  • Microfluidics to study Phenotypic Heterogeneity in Mycobacteria Intérêt de la microfluidique pour l’étude de l’hétérogénéité phénotypique des mycobactéries
  • • Tuberculosis in China La tuberculose en Chine

Evaluation / Évaluation

Weekly tests plus a final QCM test will allow obtaining a certification of successful attending to the course.

Des épreuves hebdomadaires et une épreuve terminale de type QCM, permettent l’obtention de l’attestation de suivi avec succès.

Frequently Asked Questions

Targeted audience /A qui s’adresse ce MOOC ?

This MOOC is aimed at medical doctors, researchers, biology students and more generally at a public with a scientific background.

Ce MOOC s’adresse aux médecins, aux chercheurs, aux étudiants en biologie et plus généralement à un public scientifique large.

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