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Index des ressources techniques Technical Resource index

De nombreuses ressources vous expliquant comment installer, configurer et utiliser les outils sont disponibles dans ce Mooc. Toutes les ressources de ce cours sont visibles depuis FUN mais, hormis les vidéos, elles sont aussi stockées dans l'entrepôt GitLab des ressources du Mooc RR, accessible en lecture à tout public, sous forme de fichiers Orgmode.
Cet index des ressources vous permet de les retrouver.

Many resources explaining how to install, configure and use the tools are available in this Mooc. All resources except for the videos in this course are stored in a GitLab repository of Mooc RR resources which is publicly accessible, as Orgmode files.
This resource index allows you to quickly find a resource, in FUN or in the GitLab repository.

Markdown
GitLab - Git
Jupyter
Rstudio
Org-mode
Logiciels d'indexation
Python et langage R

Markdown

Lien dans l'entrepôt Gitlab GitLab repository Link

Lien dans une page web de FUN Link in a FUN web page

🎬 M1.3. Markdown / pandoc : syntaxe du langage de balisage léger Markdown et outil Pandoc : syntax of the Markdown light markup language and the Pandoc tool
📄 Introduction à Markdown Introduction to Markdown 🔗 M1.3. Du fichier texte au langage de balisage léger
Introduction à MarkdownForm text files to lightweight markup languages
Introduction to Markdown
📄 Markdown : Resources complémentaires Markdown additional ressources 🔗 M1.3. Du fichier texte au langage de balisage léger-Ressources complémentairesForm text files to lightweight markup languages-Additional resources

GitLab - Git

Lien dans l'entrepôt Gitlab GitLab repository Link

Lien dans une page web de FUN Link in a FUN web page
🎬 M1.4. Présentation de Gitlab : Gitlab presentation: ce tutoriel présente l'interface de Gitlab et les fonctionnalités de base this tutorial introduces to the Gitlab interface and basic features. 
🎬 M1.4. Historique et retour arrière dans Gitlab : History and revert with Gitlab: cette vidéo montre comment visualiser l'historique complet des modifications d'un fichier donné et comment revenir à une version potentiellement très antérieure de ce fichier this video shows how to view the complete history of changes to a given file and how to revert to a potentially very old version of that file
🎬 M1.4. Configurer Git pour Gitlab Configure Git for Gitlab : comment configurer Git sur sa machine afin de faciliter les interactions avec Gitlab : how to configure Git on your machine to facilitate interactions with Gitlab. 
📄 Gestion de version avec GitLab et Git dans le MOOC "Recherche reproductible" Version control with GitLab and Git in the "Reproducible research" MOOC 🔗 M1.4 Pérennité et évolutivité des notes avec la gestion de version (Gitlab)
Gestion de version avec GitLab et Git dans le MOOC "Recherche reproductible"Notes (and codes) that are archived but can evolve with version control systems (Gitlab)
Version control with GitLab and Git in the "Reproducible research" MOOC
📄 Installer et configurer Git, en utilisant Git via les lignes de commande pour synchroniser vos fichiers locaux avec Gitlab  Installing and configuring Git, using Git through the command line to synchronize your local files with Gitlab 🔗 M2.7. Installations, configurations-Git et GitLab
installation, configurationInstallations, configurations-Git and GitLab
Installation, configuration
🔗 M2.7 Installations, configurations-Git et GitLab
Ressources externes pour découvrir Git Installations, configurations-Git and GitLab
External resources to discover Git
🎬 M2.7. Création d'un dépôt sur Gitlab.com, copie et clonage  Creating a repository on Gitlab.com, copying and cloning
🎬 M2.7. Faire une recherche dans Gitlab Search function from Gitlab
🎬 M2.7. Commande Linux git checkout pour "revenir en arrière" Linux command "git checkout"
📄 Obtenir des informations sur votre dépôt Git Getting information about your Git repository 🔗 M4. Ressources
Obtenir des informations sur votre dépôt Git Additional resources
Getting information about your Git repository

Jupyter

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🎬 M2.4A Prise en main de l'outil Jupyter Getting started with Jupyter : vidéo du cours qui présente comment Jupyter a été intégré au MOOC et au GitLab. Sous la vidéo, un bouton permet d'accéder à son environnement Jupyter : video of the course that shows how Jupyter was integrated into MOOC and GitLab. Below the video, a button allows you to access your Jupyter environment
📄 Jupyter trucs et astuces Jupyter tips and tricks : créer, importer un notebook, executer du code R et Python dans le même notebook, utilisation d'autres langages : creating or importing a notebook, running R and Python in the same notebook, Other languages 🔗 M2.4A Prise en main de l'outil Jupyter
trucs et astuces Getting started with Jupyter
tips and tricks
📄 Installer et configurer Jupyter sur son ordinateur Installing and configuring Jupyter on your computer 🔗 M2.4A Prise en main de l'outil Jupyter
Installation et configuration Getting started with Jupyter
Installing and configuring
🔗 M2.4A Prise en main de l'outil Jupyter
Partager un notebook Jupyter Getting started with Jupyter
Share a Jupyter notebook
🔗 M2.4A Prise en main de l'outil Jupyter
Importer un notebook Jupyter Getting started with Jupyter
Import a Jupyter notebook

Rstudio

Lien dans l'entrepôt Gitlab GitLab repository Link

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🎬 M2.4B Prise en main de l'outil RStudio Getting started with RStudio : vidéo du cours qui présente RStudio : video of the course that shows RStudio
🎬 M2.4B Rstudio - Gitlab : comment interagir avec Gitlab via Rstudio : how to interact with Gitlab via Rstudio
📄 Installer RStudio, documentation, utiliser Git avec RStudio  Installing RStudio, documentation, using Git from RStudio 🔗 M2.4B Prise en main de l'outil R studio
Installation/utilisation de RStudio, interaction avec gitGetting started with RStudio
installation, use, interaction with git

Org-mode, Emacs

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🎬 M2.4C Prise en main de l'outil OrgMode/Emacs Getting started with OrgMode/Emacs : vidéo du cours qui présente OrgMode avec Emacs : video of the course that shows OrgMode with Emacs
🎬 M2.4C Mise en place Emacs/Org-mode Setting up Emacs/Org-mode : comment mettre en place sur sa machine une configuration d'Emacs/Org-mode adaptée à la recherche reproductible. : how to set up on your machine a configuration of Emacs/Org-mode adapted to reproducible search
🎬 M2.4C Utilisation Emacs/Git Use Emacs/Git : comment cloner sur sa machine un dépôt Gitlab et comment interagir avec Git lorsque l'on utilise Emacs : how to clone a Gitlab repository on your machine and how to interact with Git when using Emacs
🎬 M2.4C Écrire un article réplicable avec Emacs/Org-mode Write a replicable article with Emacs/Org-mode : comment mettre en place sur sa machine une configuration d'Emacs/Org-mode adaptée à la recherche reproductible. : how to write a replicable article with Emacs/Org-mode
📄 Installer Emacs, org-mode, ESS et AUCTeX Installing Emacs, org-mode, ESS and AUCTeX 🔗 M2.4C Prise en main de l'outil Emacs/OrgMode
Installation d'Emacs Getting started with Emacs/OrgMode
Installing Emacs
📄 Premiers pas avec Emacs/org-mode First steps with Emacs as a computationnal environment 🔗 M2.4C Prise en main de l'outil Emacs/OrgMode
Premiers pas avec Emacs/org-modeGetting started with Emacs/OrgMode
First steps with Emacs as a computationnal environment
📄 Configuration d'Emacs pour une "recherche reproductible" stable A simple "reproducible research" Emacs configuration 🔗 M2.4C Prise en main de l'outil Emacs/OrgMode
Une configuration Emacs adaptée à la "recherche reproductible"Getting started with Emacs/OrgMode
A simple "reproducible research" emacs configuration
📄 Emacs : trucs et astuces Emacs: tips and tricks 🔗 M2.4C Prise en main de l'outil Emacs/OrgMode
Trucs et astucesGetting started with Emacs/OrgMode
Emacs tips and tricks

Logiciels d'indexation Desktop search tools

Lien dans l'entrepôt Gitlab GitLab repository Link

Lien dans une page web de FUN Link in a FUN web page

🎬 M1.5. DocFetcher : comment utiliser le moteur de recherche de bureau DocFetcher pour trouver rapidement les fichiers « intéressants » sur son disque dur : how to use the DocFetcher desktop search engine to quickly find "interesting" files on your hard drive
🎬 M1.5. ExifTool : comment utiliser ExifTool pour rajouter des métadonnées à un fichier JPEG et, par là, comment rajouter des étiquettes ou mots-clés à un tel fichier. : how to use ExifTool to add metadata to a JPEG file and, in the process, how to add labels or keywords to such a file

Langages Python et R Python and R languages

Lien dans l'entrepôt Gitlab GitLab repository Link

Lien dans une page web de FUN Link in a FUN web page

📄 Obtenir des informations sur les librairies Python 3 Getting information about Python(3) libraries 🔗 M4. Ressources
Obtenir des informations sur les librairies Python 3 Additional resources
Getting information about Python(3) libraries
📄 Obtenir des informations sur les packages R Getting information about R libraries 🔗 M4. Ressources
Obtenir des informations sur les packages R Additional resources
Getting information about R libraries
📄 Installation de Python, R and LaTeX Python, R and LaTeX installation 🔗 M4. Installations, configurations
Installation de Python, R and LaTeX Installations, configurations
Python, R and LaTeX installation
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