Marie-Hélène LE DU
Chercheur au CEA, responsable d’équipe à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC)
- End of Registration
- dec 14 2020
- Classes Start
- nov 02 2020
- Classes End jan 16 2021
- Estimated Effort
- 3 h/week
- Language
- French
- Thematics
- Physique
- Sciences de la vie
A propos du cours
L’utilisation des structures tridimensionnelles de macromolécules biologiques fait partie du quotidien d’un grand nombre de biologistes. Ces structures permettent de comprendre leur fonctionnement, de dessiner des mutants pour étudier leur fonction, de dessiner des molécules pour les bloquer ou les activer.
L’approche majeure pour résoudre la structure tridimensionnelle de macromolécules biologiques est la cristallographie aux rayons X. Ce MOOC est une initiation complète à la cristallographie biologique : depuis l'histoire de la méthode jusqu'à ses outils concrets.Nous vous transmettons nos connaissances et notre expérience par le biais de vidéos théoriques et en situation.
A la fin de ce MOOC vous serez capable :
- d’exploiter les structures tridimensionnelles avec un bon sens critique,
- de résoudre la structure tridimensionnelle d’une macromolécule par cristallographie.
Vous pourrez également mettre en application vos nouvelles connaissances au cours de la dernière semaine.
Prérequis
Ce MOOC a été conçu pour des étudiants en biologie, des étudiants en thèse, des stagiaires postdoctorants, des techniciens, ingénieurs ou chercheurs en biologie. Cependant, quelques bases scientifiques et une bonne dose de curiosité peuvent être suffisants.
Les vidéos peuvent être sous-titrées en français ou en anglais si nécessaire.
Plan du cours
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Des exemples aux méthodes
- Des structures tridimensionnelles : pourquoi faire ?
- Des structures tridimensionnelles : comment faire ?
- Histoire de la cristallographie aux rayons X
-
La fabrication des cristaux
- Choix, production, purification de l'échantillon
- Cristalliser une macromolécule biologique
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Voyage au synchrotron SOLEIL
- Les rayons X : Comment et Pourquoi ?
- L'acquisition des données de diffraction
- Les données de diffraction : aujourd'hui et demain
-
Retour vers l'espace réel
- Le problèmes des phases
- La résolution de la strucure cristallographique
- La construction, l'interprétation et l'analyse du modèle
-
Dans la peau d'un cristallographe
- Traitement d'un jeu de données
- Résolution d'une structure
- Construction et manipulation du modèle
Équipe pédagogique
Pierre LEGRAND
Scientifique de ligne sur PROXIMA-1, synchrotron SOLEIL
Yves MECHULAM
Directeur de Recherche au CNRS, Professeur à l’Ecole polytechnique
Sylvain RAVY
Directeur de Recherche au CNRS Laboratoire de Physique des Solides, Université Paris-Sud
Serena SIRIGU
Scientifique de ligne sur PROXIMA-2, synchrotron SOLEIL
Experts
Stéphane Bressanelli
Directeur de recherche au CNRS, responsable d’équipe à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC)
Jean-Baptiste CHARBONNIER
Chercheur au CEA, responsable d’équipe à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC)
Léonard CHAVAS
Responsable de ligne sur PROXIMA-1, synchrotron SOLEIL
Bruno ROBERT
Directeur de recherche au CEA, responsable du département biochimie, biophysique et biologie structurale à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC)
Carine TELLIER
Assistante Ingénieur au CEA, Institut de Biologie Intégrative de la Cellule
Andrew THOMPSON
Directeur scientifique du synchrotron SOLEIL
Sophie ZINN-JUSTIN
Chercheur au CEA, responsable d’équipe à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC)
Évaluation
Deux types d'évaluations vous seront proposées :
Un niveau 2 pourra être délivré à ceux qui réussissent au moins une activité de la semaine 6
Partenaires
Le MOOC « Voyage au cœur du vivant avec des rayons X : la cristallographie » est le fruit d’une étroite collaboration entre plusieurs établissements au sein de l’Université Paris-Saclay, porté par le CEA de Saclay en collaboration avec le synchrotron SOLEIL et l’Ecole polytechnique.
Remerciements :
