Biobanques
Réf. 96019
Les aspects organisationnels d'une biobanque, de l'échantillonnage, de la collecte, des équipements, du transport et de la conservation des ressources biologiques sont abordés.
- Durée : 8 semaines
- Effort : 24 heures
- Rythme: ~3 heures/semaine
- Langues: Anglais et français
Ce que vous allez apprendre
À la fin de ce cours, vous saurez :
- Comprendre comment ces biobanques permettent aux utilisateurs finaux d'avoir un accès permanent à des échantillons adaptés à leurs besoins.
- Savoir comment le stockage à long terme des échantillons doit être structuré.
- Être conscient de l'éthique, des aspects réglementaires et des questions de qualité qui sous-tendent la préservation et la distribution des ressources biologiques.
- Comprendre comment les biobanques sont reliées entre elles dans le monde entier.
Description
Les biobanques sont des entités assurant la gouvernance, la gestion et la conservation des ressources biologiques, telles que les cellules vivantes, les virus, les bactéries et les champignons, ainsi que les données qui leur sont associées. L'objectif majeur des biobanques est de préserver ces ressources dans des conditions optimales afin de maintenir leur intégrité et de les mettre à la disposition de la communauté scientifique pour faire progresser la recherche et les connaissances dans le monde entier et faciliter le développement de médicaments, de vaccins ou de tests de diagnostic innovants.
Dans ce MOOC, sont abordés les aspects organisationnels de recueil, de transport et de conservation de différents matériaux biologiques, variables en fonction du matériel considéré, ainsi que l’organisation et la gestion d’une biobanque et de son équipement. Les particularités liées au prélèvement et à la conservation de specimens biologiques d’origine humaine sont abordées. Plusieurs sessions sont consacrées au contrôle de qualité de ces biobanques pour répondre à la régulation internationale.
Format
Ce MOOC est composé de 4 chapitres pédagogiques, le premier sur les considérations générales, le second sur les sciences des échantillons biologiques et des données, le troisième sur les questions internationales, juridiques et éthiques et enfin, le quatrième sur des exemples pratiques. Chaque chapitre comporte 4 à 7 séquences. Chaque séquence est composée de vidéos de 10 à 20 minutes et de QCMs permettant aux étudiants de tester leurs connaissances. Les vidéos sont en anglais et sous-titrées en français et en anglais.
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Prérequis
Ce MOOC est destiné aux étudiants de biologie, du premier cycle à la thèse, aux médecins, aux enseignants, aux chercheurs, et plus généralement à tous ceux qui s'intéressent aux biobanques et à leur gestion. Un bon bagage scientifique est recommandé pour suivre ce MOOC (niveau licence)
Équipement requis
Un ordinateur avec un navigateur et une émission de son, ainsi qu'une connexion internet suffisante sont requis pour suivre le MOOC.
Evaluation et Certification
Pour suivre ce cours, vous avez le choix entre deux formules :
- Le Parcours Découverte donne accès aux vidéos, aux quiz et aux échanges dans le forum. Ce parcours ne donne pas lieu à la délivrance d'un badge. L'inscription est gratuite.
- Le Parcours Qualifiant permet d'obtenir un certificat. En complément des activités du Parcours Découverte, vous devrez suivre un examen surveillé à distance d’une durée d'une heure, consistant en 30 questions à choix multiples (QCM) et d'obtenir 18 bonnes réponses. Le prix de l’inscription au parcours qualifiant est de 150€.
La réussite au parcours Qualifiant vous offre l’opportunité de candidater au Diplôme Numérique des Maladies Infectieuses de l'Institut Pasteur (DNM2IP), qui consiste en l’obtention de 5 certificats à des MOOCs de l’Institut Pasteur portant sur les maladies infectieuses. Pour en savoir plus sur ce diplôme, consultez la page web de l'Institut Pasteur, dédiée à ce diplôme.
Accessibilité
Les vidéos du MOOC sont toutes sous-titrées, en anglais et en français. Leur vitesse de lecture peut être accélérée ou ralentie selon votre besoin.
Les sous-titres sont également regroupés sous un format texte pour chaque vidéo, ce sont les transcriptions, accessibles sous chaque vidéo.
Enfin, de plus en plus de MOOCs comportent également ce que nous avons appelé le BOOC. C'est un document PDF regroupant l'ensemble des transcriptions et auxquelles ont été ajoutés les images et les schémas utiles à la compréhension. Le BOOC est téléchargeable.
Plan de cours
- C1-1: Définitions et introduction, qu'est-ce qu'une biobanque ? / Fay Betsou
- C1-2: Pourquoi les biobanques sont-elles importantes ? / Fay Betsou
- C1-3: Biospécimens et reproductibilité de la recherche / Fay Betsou
- C1-4: Gestion de la qualité / Fay Betsou
- C1-5: Les biobanques en tant que laboratoires de traitement / Fay Betsou
- C1-6: Présentation du Centre de Ressources Biologiques de l'Institut Pasteur (CRBIP) / Fay Betsou
- C1-7: Méthodes de traitement dans les biobanques, l'exemple des échantillons fécaux / Fay Betsou
- C2-1: Recherche sur les échantillons biologiques / Fay Betsou
- C2-2: Validation et vérification des méthodes de traitement, théorie / Fay Betsou
- C2-3: Validation et vérification des méthodes de traitement, pratique / Fay Betsou
- C2-4: Matériaux de référence / Fay Betsou
- C2-5: Gestion et qualité des données au Centre de Ressources Biologiques de l'Institut Pasteur (CRBIP) / Mariana Ferrari
- C2-6: Un exemple, l'étude du système de gestion de l'information (Biobank Information Management System ou BIMS) / Augusto Mantilla Ayala
- C3-1: Organisations professionnelles internationales de biobanques / Fay Betsou
- C3-2: Normes et codes de normes / Fay Betsou
- C3-3: Essais d'aptitude pour les laboratoires de biobanques / Fay Betsou
- C3-4: Aspects juridiques des biobanques / Fay Betsou
- C3-5: Protocole de Nagoya / Raquel Hurtado-Ortiz
- C3-6: Transport de matériel biologique / Fay Betsou
- C3-7: Questions éthiques / Fay Betsou
- C4-1: Présentation de la collection de l'Institut Pasteur (CIP) / Dominique Clermont
- C4-2: Méthodes de conservation des champignons / Dirk Strubbe
- C4-3: Méthodes de culture et de conservation des cyanobactéries / Muriel Gugger
- C4-4: L'éthique dans une crise sanitaire - Les leçons d'Ebola / Virginie Pirard
Équipe pédagogique
Fay BETSOU
Catégories
Directrice du MOOC, Fay est une scientifique avec 25 ans d’expérience transdisciplinaire dans les opérations et les applications des biobanques
Raquel HURTADO-ORTIZ
Catégories
Community manager du MOOC, Raquel est microbiologiste et immunologiste avec une expérience dans la gestion de Collections et Biobanques. Elle est responsable de la Collection Nationale de Cultures de Microorganismes (CNCM) à l'Institut Pasteur, Paris.
Établissements
Licence
Licence pour le contenu du cours
Attribution - Pas d’Utilisation Commerciale - Pas de Modification
Vous êtes autorisé à :
- Partager — copier, distribuer et communiquer le matériel par tous moyens et sous tous formats
Selon les conditions suivantes :
- Attribution — Vous devez créditer l'oeuvre, intégrer un lien vers la licence et indiquer si des modifications ont été effectuées à l'oeuvre. Vous devez indiquer ces informations par tous les moyens raisonnables, sans toutefois suggérer que l'offrant vous soutient ou soutient la façon dont vous avez utilisé son oeuvre.
- Pas d’Utilisation Commerciale — Vous n'êtes pas autorisé à faire un usage commercial de cette oeuvre, tout ou partie du matériel la composant.
- Pas de modifications — Dans le cas où vous effectuez un remix, que vous transformez, ou créez à partir du matériel composant l'oeuvre originale, vous n'êtes pas autorisé à distribuer ou mettre à disposition l'oeuvre modifiée.
Licence pour le contenu créé par les participants du cours
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