Enrollment is closed
  • End of Registration
  • Registration closed
  • Classes Start
  • apr 27 2020
  • Classes End
  • jun 22 2020
  • Certification
  • Get a certificate for 150 €
  • Estimated Effort
  • 02:00 h/week
  • Language
  • English

About this MOOC/ À propos de ce MOOC

Stem cells have the spectacular ability to restore the function of damaged tissues, providing major opportunities for fundamental studies on organogenesis, regeneration, diseases, and ageing. In spite of intense research in this field, many unanswered questions remain regarding stem cell regulation and function.

The Advances in Stem Cell Biology MOOC was created to provide an overview of stem cell biology, the properties of stem cells and their potential in directing organogenesis and regeneration in different organisms, and how they can be exploited for therapeutic purposes.
During this MOOC you will learn about the characteristics and properties of stem cells, along with the latest discoveries in the field from general concepts to different categories of stem cells, and how they participate in organogenesis in the organism - and in vitro.

Les cellules souches ont la capacité spectaculaire de restaurer la fonction des tissus endommagés, offrant des opportunités majeures pour des études fondamentales sur l'organogenèse, la régénération, les maladies et le vieillissement. Malgré d'intenses recherches dans ce domaine, de nombreuses questions restent sans réponse concernant la régulation et la fonction des cellules souches.

Le MOOC Advances in Stem Cell Biology a été créé pour fournir un aperçu de la biologie des cellules souches, des propriétés des cellules souches et de leur potentiel pour diriger l'organogenèse et la régénération dans différents organismes, et la manière dont elles peuvent être exploitées à des fins thérapeutiques. Au cours de ce MOOC, vous découvrirez les caractéristiques et les propriétés des cellules souches, ainsi que les dernières découvertes dans le domaine, des concepts généraux aux différentes catégories de cellules souches, et de quelle façon elles participent à l'organogenèse dans l'organisme - et in vitro.

Enrollement types/Formules d'inscription

To follow this course, you have the choice between two formulas: DISCOVERY formula which will allow you to familiarize yourself with the subject thanks to videos, quizzes and access to forums and QUALIFYING formula in which you can acquire skills and deep knowledge on the subjects.

Discovery path

If you opt for this formula, you will have access to the videos of the course, the quizzes and the exchanges in the forums. This route will not give rise to the issue of a certificate. Registrations are possible now and are not subject to any conditions. This registration is free.


Qualifying path

  • In addition to the activities offered in the DISCOVERY formula, the QUALIFYING formula will allow you to obtain a certificate in the form of a "certificate". To do this, you will have to take a final individual exam, monitored remotely, lasting 1 hour, consisting of 30 multiple choice questions (MCQ) and obtaining 20 correct answers. You will also have access to hangouts.

  • The registration fee for the qualifying course is 150€.



Pour suivre ce cours, vous avez le choix entre deux formules: formule DECOUVERTE qui vous permettra de vous familiariser avec le sujet grâce aux vidéos, quiz et accès aux forums et formule QUALIFIANTE dans laquelle vous pourrez acquérir un certificat.

Parcours Découverte


Si vous optez pour cette formule, vous aurez accès aux vidéos du cours, aux quiz et aux échanges dans les forums. Ce parcours ne donnera pas lieu à la délivrance d'une attestation. Les inscriptions, gratuites, sont possibles dès à présent et ne sont soumises à aucune condition.

Parcours Qualifiant

  • En complément des activités proposées dans la formule DECOUVERTE, la formule QUALIFIANTE vous permettra d'obtenir une attestation sous la forme d'un "certificat". Pour cela, vous devrez suivre un examen individuel final surveillé à distance d’une durée de 1 heure, consistant en 30 questions à choix multiples (QCM) et d'obtenir 20 bonnes réponses. Vous aurez également accès à des hangouts.

  • Le prix de l’inscription au parcours qualifiant est de 150€.

Certificate and attestation of follow-up / Certificat et attestation de suivi

Please note, only the "Qualifying" formula gives the right to a qualifying certification issued by Fun and the Institut Pasteur. In addition, there will be no certificate of successful follow-up, neither for the "Discovery" formula, nor for the "Qualifying" formula.

Attention, seule la formule "Qualifiante" donne droit à une certification qualifiante délivrée par Fun et l'institut Pasteur. Par ailleurs, il n'y aura pas d'attestation de suivi avec succès, ni pour la formule "Découverte", ni pour la formule "Qualifiante".

MOOC Format/Format du MOOC

This MOOC is organized in 5 chapters of 2 to 10 sessions each. Each session includes a short video and 2 multiple choice questions in english to help you test your understanding. There are 4 to 20 multiple choice questions at the end of each chapter. A certification exam (in English) is accessible only for students registered to the “qualifying path”. The videos are in English, subtitles in English and French are provided.

Le MOOC est divisé en 5 chapitres de 2 à 10 sessions. Chaque session comporte une courte vidéo et 2 questions à choix multiple pour tester votre compréhension de la session. A la fin de chaque chapitre, 4 à 20 questions à choix multiple (en anglais et en français) vous seront posées. Un examen de certification (en anglais) est proposé aux étudiants inscrits au parcours Qualifiant. Les vidéos sont en anglais, sous-titrées en anglais et en français.

Target audience/Public ciblé

This MOOC aims to reach anybody who wishes to learn more about emerging viruses and pandemics, whether scientist, medical doctor or other health workers, staff of governmental and non-governmental agencies or students in life sciences.

Ce MOOC est destiné à toute personne souhaitant approfondir ses connaissances sur les virus émergents et les épidémies, scientifiques, médecins et autres personnels de santé, personnels des agences gouvernementales et non gouvernementales, étudiants des sciences de la vie.

Requirements /Pré-requis

We recommend a good scientific background (such as a bachelor of life science)/ Un bon niveau scientifique est recommandé pour suivre ce MOOC (licence en sciences de la vie).



Course Staff

Shahragim Tajbakhsh

Shahragim Tajbakhsh

Prof. Shahragim Tajbakhsh – Stem Cells and Development team at Institut Pasteur.

The research of the Tajbakhsh laboratory focuses on identifying and characterizing skeletal muscle stem cells. His lab aims to characterize stem cells, and their daughters, during embryonic and postnatal development of skeletal muscle to understand how this tissue is established, and how it regenerates during disease, and after injury. They are examining the genetic networks, which regulate myogenic stem cell emergence, and relating this to how cell order is established in this lineage. They are also investigating how stem/progenitor cells self-renew, essentially via symmetric vs. asymmetric cell divisions, and how the stem cell niche is defined.

Les recherches du laboratoire de Shahragim Tajbakhsh se concentrent sur l'identification et la caractérisation des cellules souches musculaires squelettiques. Son laboratoire vise à caractériser les cellules souches et leurs filles au cours du développement embryonnaire et postnatal du muscle squelettique afin de comprendre comment ce tissu est établi et comment il se régénère pendant la maladie et après une blessure. Ils examinent les réseaux génétiques, qui régulent l'émergence des cellules souches myogéniques, et relient cela à la façon dont l'ordre cellulaire est établi dans cette lignée. Ils étudient également comment les cellules souches progénitrices s'auto-renouvellent, essentiellement via des divisions cellulaires symétriques vs asymétriques, et comment la niche des cellules souches est définie.

Vania Rosas Magallanes

Vania Rosas Magallanes

Vania Rosas has a PhD in microbiology, with experience in the management of European and national projects. She is the project officer of the LabEx Revive, which is part of the French governmental initiative “Investments for the future”, coordinated by the Institut Pasteur and that includes training activities around stem cell biology. She supports the project management activities at the Institut Pasteur Grants Office as well, principally on the ethical aspects on European funded projects

Vania Rosas est titulaire d'un doctorat en microbiologie, avec une expérience dans la gestion de projets européens et nationaux. Elle est chargée de mission au LabEx Revive, qui fait partie de l'initiative gouvernementale française «Investissements pour l'avenir», coordonnée par l'Institut Pasteur et qui comprend des activités de formation autour de la biologie des cellules souches. Elle soutient également les activités de gestion de projet à l'Institut Pasteur Grants Office, principalement sur les aspects éthiques des projets financés par l'Europe.

With the participation of /Avec la participation de

Shahragim Tajbakhsh (Institut Pasteur, France), François Schweisguth (Institut Pasteur, France), Marc Van de Wetering (Princess Maxima Center for Pediatric Oncology, Netherlands), Allison Bardin (Institut Curie, France), Ana Cumano (Institut Pasteur, France), Philippe Herbomel (Institut Pasteur, France), Pierre-Marie Lledo (Institut Pasteur, France), Matthias Lutolf (EPFL, Switzerland), Sigolène Meilhac (Institut Pasteur, Institut Imagine, France) Laurence Daheron (Harvard Stem Cell Institute, USA), Kat Hadjantonakis (Sloan Kettering Institute, USA), Jenny Nichols (Cambridge Stem Cell Institute, UK), Alfonso Martinez Arias (University of Cambridge, UK), Emmanuelle Rial-Sebbag (Inserm, France)



Course syllabus /Plan du cours

  • Chapter 1. General concepts in stem cell biology
  • Chapter 2. Tissue specific stem cells
  • Chapter 3. Pluripotent stem cells
  • Chapter 4. Organoids
  • Chapter 5. Stem cell applications


Chapter 1 – General concepts in stem cell biology /Concepts généraux sur les cellules souches.

  • W1-1: What are Stem cells / Que sont les cellules souches ?
  • W1-2: What defines the fate of stem cells ? / Qu'est-ce qui définit le sort des cellules souches ?
  • W1-3: Introduction to asymmetric cell division / Introduction à la division cellulaire asymmétrique.
  • W1-4: Asymmetric cell division: the cellular and molecular processes / Division cellulaire asymétrique: les processus cellulaires et moléculaires.

Chapter 2 – Tissue specific stem cells /Les cellules souches tissulaires spécifiques.

  • W2-1: Intestinal stem cells /Cellules souches intestinales.
  • W2-2: Drosophila Intestinal Stem Cells / Cellules souches intestinales de drosophile.
  • W2-3: Introduction to Hematopoietic stem cells / Introduction aux cellules souches hématopoïétiques.
  • W2-4: Origins of hematopoietic stem cells / Origines des cellules souches hématopoïétiques.
  • W2-5: Tracking the journey of hematopoietic stem cells in live zebrafish embryos /Suivi du voyage des cellules souches hématopoïétiques dans des embryons de poisson zèbre vivants.
  • W2-6: Neural Stem cells / Cellules souches neuronales.
  • W2-7: Skeletal muscle identity / Identité des muscles squelettiques.
  • W2-8: Skeletal muscle stem cell properties and ageing /Propriétés et vieillissement des cellules souches des muscles squelettiques.
  • W2-9: Deconstructing and reconstructing a satellite cell niche /Déconstruire et reconstruire une niche de cellules satellites.
  • W2-10: Heart regeneration / Régénération cardiaque.

Chapter 3 – Pluripotent stem cells /Les cellules souches sont pluripotentes.

  • W3-1: Human pluripotent stem cell derivation /Dérivation de cellules souches pluripotentes humaines.
  • W3-2: What are the most common methods to generate iPSCs ? /Quelles sont les méthodes les plus courantes pour générer des iPSC?
  • W3-3: Specification and segregation of embryonic vs. extra-embryonic stem cells /Spécification et ségrégation des cellules souches embryonnaires vs extra-embryonnaires.
  • W3-4: Differentiation of ICM cells: the underlying mechanisms /Différenciation des cellules ICM: les mécanismes sous-jacents.
  • W3-5: Derivation of mouse embryonic stem cells /Dérivation de cellules souches embryonnaires de souris.
  • W3-6: Derivation of human embryonic stem cells /Dérivation de cellules souches embryonnaires humaines.

Chapter 4: Organoids /Organoïdes

  • W4-1: Using ES cells to understand how cells build organisms /Utiliser les cellules ES pour comprendre comment les cellules construisent des organismes.
  • W4-2: Self-organization of embryonic organoids /Auto-organisation des organoïdes embryonnaires.

Chapter 5: Stem cell applications /Applications des cellules souches.

  • W5-1: Intestinal cancer stem cells /Cellules souches du cancer intestinal.
  • W5-2: The bioethics of stem cell research and therapy /La bioéthique de la recherche et de la thérapie sur les cellules souches.

Frequently Asked Questions

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This MOOC was created by the Education Department of the Institut Pasteur.

This MOOC was realized with the support of the Fondation IPSEN, under the eagis of Fondation de France.

This MOOC was realized with the support of the LaBex REVIVE.

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