La compréhension du “vivant” est un sujet passionnant : qu’est-ce qui caractérise la vie d’un organisme ? Quels mécanismes biologiques en garantissent l’évolution?
Pour répondre à ces questions, nous vous proposons tout d’abord un voyage au coeur des cellules, nous remontrons ainsi le temps jusqu’à isoler l’ancêtre cellulaire de tous les êtres vivants: LUCA (Last Universal Common Ancestor).
Nous nous plongerons ensuite dans le fonctionnement intime des cellules, où nous observerons l’usine chimique qui est à l’oeuvre grâce aux molécules biologiques : ADN, protéines, lipides et ARN.
Nous étudierons ensuite l’hypothèse du monde ARN, qui propose une description du monde du vivant avant l’apparition de la première cellule.
Le cours est organisé en trois sections et se déroule pendant 6 semaines.
Le cours propose de suivre un parcours parmi trois: 1) découverte, avec les vidéos et des quizz, 2) approfondissement, avec des exercices qui donneront lieu à la rédaction d'un rapport puis d'une évaluation par les pairs; et 3) simulation, avec des exercices réalisés principalement sur ordinateur avec des logiciels gratuits. Vous pourrez ainsi explorer la structure et la dynamique des protéines avec le jeu de découverte scientifique Foldit et expérimenter la dynamique des ARN en réalisant une simulation interactive d’ARN avec le logiciel UnityMol.
Pour suivre le cours, il est nécessaire de connaitre les notions préalables liées aux atomes, molécules, cellules. Ces notions correspondent à un niveau de section S en lycée. Elle peuvent être reprises avec ce module unisciel.
Pour suivre le parcours simulation un ordinateur et système d'exploitation récents sont nécessaires.
Antoine est chercheur au laboratoire de Biochimie Théorique (CNRS/Université Paris Diderot) où il étudie la dynamique des biomolécules. Il est également enseignant en Biologie dans la licence "Frontières du vivant" de l'université Paris Descartes.
Samuela est maître de conférences à l’université Paris Diderot, responsable des cours de Mathématiques et de Bioinformatique auprès des étudiants de première et de troisième année de la licence de Sciences de la vie. Au laboratoire de Biochimie Théorique, Samuela s’est impliquée dans des projets de développement de logiciels dont notamment le logiciel de simulation moléculaire UnityMol que vous découvrirez à la fin du cours.
Marc Baaden est chercheur au laboratoire de Biochimie Théorique (CNRS/ Université Paris Diderot) et développe un axe de recherche autour de la visualisation moléculaire et la manipulation interactive de données scientifiques. A travers le logiciel UnityMol, il a façonné un support pédagogique innovant ouvrant un accès ludique et engageant au monde moléculaire.
Sébastien Doutreligne est doctorant au Laboratoire de Biochimie Théorique (CNRS/IBPC). Informaticien de formation, il fait partie de l'équipe de développement de UnityMol. Il s'investit aussi dans la recherche liée aux simulations moléculaires interactives pour la biologie et les interactions homme/machine au moyen de dispositifs issus de la réalité virtuelle.
L'évaluation est constituée d'une part de quiz hebdomadaires et d'autre part de devoirs obligatoires avec dates précises de rendu permettant une évaluation par les pairs (selon parcours).
Le MOOC propose une attestation de suivi avec succès (parcours 2).
L'Université Paris Diderot est membre de l'Université Sorbonne Paris Cité
L'Université Paris Descartes est membre de l'Université Sorbonne Paris Cité
Ce cours est financé sur le programme Mooc Factory soutenu par la Mairie de Paris et mis en oeuvre par SCIRE.
Cette licence permet aux autres de distribuer, remixer, arranger, et adapter votre œuvre, même à des fins commerciales, tant qu’on vous accorde le mérite de la création originale en citant votre nom. C’est le contrat le plus souple proposé. Recommandé pour la diffusion et l’utilisation maximales d’œuvres licenciées sous CC.
Cette licence est la plus restrictive des six licences principales, n’autorisant les autres qu’à télécharger vos œuvres et à les partager tant qu’on vous crédite en citant votre nom, mais on ne peut les modifier de quelque façon que ce soit ni les utiliser à des fins commerciales.
